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Illumina Miseq是2011年2月推出的新一代小型化（bench-top）測序儀，這款儀器使用了Illumina TruSeq可逆中止堿基邊合成邊測序的化學(xué)方法，與HiSeq 2000相比，雖然每個(gè)Run的測序通量很低，但是久經(jīng)考驗(yàn)的新一代測序試劑帶來的準(zhǔn)確性，結(jié)合上全新的流體系統(tǒng)，使得一個(gè)測序循環(huán)時(shí)間縮短了8倍以上。

　　技術(shù)特點(diǎn)

　　1、測序周期短：Miseq V2 150PE運(yùn)行時(shí)間短至24小時(shí)，可用于快速高效的擴(kuò)增子測序或小基因組測序，以極少的時(shí)間完成數(shù)據(jù)量需求較少的項(xiàng)目。

　　2、Pair-end 讀長達(dá)250bp：Miseq測序讀長已經(jīng)達(dá)到2×250bp，可有效地跨越復(fù)雜基因組的高度重復(fù)區(qū)域，從而提高拼裝的效果，更有利于進(jìn)行基因注釋和基因功能的深入挖掘。

　　3、測序流程便捷：小巧、一體化的MiSeq平臺(tái)整合了cluster生成，Pair-end測序和完整的數(shù)據(jù)分析，節(jié)省了實(shí)驗(yàn)室空間。通過直觀的觸摸屏界面開展簡單的儀器操作，即插即用的試劑帶有RFID追蹤，具有自動(dòng)化的便利。

　　測序流程

　　應(yīng)用范圍

　　1、擴(kuò)增子測序

　　長的末端配對讀取能力、速度與高數(shù)據(jù)質(zhì)量，使得擴(kuò)增子測序的項(xiàng)目可在幾天內(nèi)完成。

　　2、轉(zhuǎn)錄組測序

　　與454測序儀相比，長度類似，價(jià)格便宜，便于實(shí)現(xiàn)De novo組裝，更全面的基因注釋。

　　3、小基因組De novo組裝

　　2×250bp讀長與高達(dá)7G的測序通量，適合如微生物這類小基因組的項(xiàng)目，拼接效果好。

　　4、微生物多樣性分析

　　2×250bp讀長，已經(jīng)可以測通一些可變區(qū)域，更有利于提高分析結(jié)果的準(zhǔn)確性。