NextSeq 550Dx是公司的第二個FDA管制和CE-IVD標記測序儀，遵循MiSeq Dx，于2013年獲得FDA的上市前批準，這是個這樣做的NGS平臺。 2014年，賽默飛世爾科技將其作為II類科研的FDA列入其Ion PGM Dx NGS系統(tǒng)。 NextSeq 550Dx具有診斷模式和研究模式，可用于臨床研究和開發(fā)體外診斷檢測。 Illumina表示，針對不同應用的工作流程設置“集成"到儀器的軟件中，并且“提供具有模塊化軟件架構的集成的板載分析軟件，以支持當前和未來的分析"。 在擴大的預期用途下，MiSeqDx儀器現在可用于由FFPE組織產生的DNA文庫。另外，Illumina現在提供受管制的MiSeqDx試劑盒v3以及TruSeq定制擴增子試劑盒Dx，用于儀器的文庫準備。這些產品取代了2013年通過FDA批準的MiSeqDx通用試劑盒1.0，使臨床實驗室能夠分析人類全血中的
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